El servicio de Anatomía Patológica esta compuesto por 8 departamentos. A continuación se desglozan las actividades que realiza el servicio por departamento:

Departamento de secretaria

Se encuentra en la entrada del servicio con los archivos y registros de la información donde permanece la secretaria que a su vez realiza funciones de recepcionista y ayuda al personal médico en el procesamiento de las piezas quirúrgicas, llevando los registros de entrada.

Departamento de Diagnóstico

Consta de 5 microscópios marca OLIMPUS con buena resolución donde trabajan los especialistas en la  lectura de las láminas previamente examinadas por los residentes en formación, se realian los diagnósticos de todo el trabajo que se recibe en el departamento y algunos casos de otros hospitales que se trae a consulta. Se discuten los fallecidos y todos los tumores malignos en colectivo, el personal está verticalizado de acuerdo a los ensayos clínicos.

Especialidad de verticalización de cada especialista:

Dermatopatología
Dra. Georgina Acosta Román

Hematopatología y Patología tumoral del riñón
Dr. Emilio Galano Estivenst

Patología tumoral del pulmón y patologías gástricas
Dra. Yamilé Velis Hung

Patología del tiroide y Patología tumoral de próstata
Dra. Rosa María Sierra Fonseca

Patología tumoral de la mama, artropatías y colagenopatías
Dra. Maricel Navarro Tordera

Departamento Laboratorio Central

Consta de 2 procesadores de tejido automático, 3 micrótomos, con 3 Baños de María, 1 desparafinador, 2 afiladores de cuchilla, 2 centrífugas y 1 mesa para iconopatografías. En el mismo se procesan todo el trabajo del departamento tanto histológico como citológico, se cortan todas las biopsias y necropsias, se preparan las cuchillas de los micrótonos y se toman imágenes  de las patologías para las discuciones científicas.

Departamento de coloraciones especiales

Consta de 1 sed de coloraciones convencionales, otro de papanicolao y un área para la histoquímica, además se montan todas las láminas que serán diagnosticadas en el departamento médico, consta además de un criostato automático para las biopsias por congelación y coloraciones de inmunoflorescencia y coloraciones especiales.

Departamento de informática

Consta de 2 computadoras, una para el SARCAP de biopsias y otra para el de necropsia y citología. Este departamento se encarga de la introducción de toda la información que sale del departamento y de procesar y ofertar al deparatamento médico y de tecnología los datos para las investigaciones científicas y oferta la información y estadística del trabajo a todo el país.

Oficina del Jefe de Departamento

Consta de un microscópio marca OLIMPUS de alta tecnología con modificaciones para la inmunoflorescencia, una computadora para el procesamiento de los trabajos científicos y las presentaciones de casos, proyectos de investigación de los residentes y trabajo de tesis de los tecnólogos, con acceso a internet, consta además de un archivo para la documentación del departamento, separado de los ensayos clínicos y un archivo particularizado de los casos evaluados e incluido en los ensayos clínicos.

Departamento de la Morgue

Consta de 3 mesas de Morgañe para la realización de autopsias, disección de cadáveres, conservación de cadáveres en algunos casos, tanque de formol para la conservación de cerebros, balanza para el pezaje de las piezas, fetos y neonatos, cámara fría para la conservación de cadáveres, FREASER para la conservación de piezas, cierra eléctrica para la estracción de encéfalos, camilla para la transportación de cadáveres y puerta de salida. Este departamento se encarga del estudio macroscópico de todas las piezas de las necropsias y piezas quirúrgicas realizándose las conclusiones macroscópicas de todos los casos que se procesan en el mismo, además consta de un archivo para guardar las piezas en formol hasta su diagnóstico.

Departamento de actividades científicas

Adjunto a la morgue se encuentra un aula equipada con pizarra, negatoscópio, mesa de presentación de piezas que consta de una estructura para el lavado y drenaje de las piezas donde se realizan las discusiones de piezas frescas, análisis de los comité de calidad y se imparte docencia.